Affymetrix 芯片平台/ scientific serving

Affymetrix表达谱芯片主要包括全转录组基因表达芯片(WT) 3’IVT基因表达芯片两大类,其特点如下:

全转录组分析芯片:采用随机引物法扩增靶标序列,对于原核生物针对开放读码框来设计探针,对于真核生物针对基因的外显子设计探针,因此可以用于全转录本表达谱分析。目前已经推出了人、小鼠、大鼠Gene 2.0 STST”Sense Target”的缩写,表示检测正义链核酸)芯片。

GeneChip®  Human Transcriptome Array 2.0芯片

HTA芯片整合了多个权威公共数据库,支持几乎所有人类转录本异构体信息分析。结合Affymetrix提供的Transcriptome Analysis Console软件,可以更加有效的利用高通量数据信息。

 

GeneChip® Mouse/Rat Transcriptome Assay 1.0

大小鼠转录组分析——一次实验,多个生物学层面分析

GeneChip®  Mouse/Rat Transcriptome Assay 1.0是快速、简便、经济地分析大小鼠转录组的表达变化的最强大最灵活的工具。

GeneChip®  Mouse Gene 2.0 芯片

GeneChip®  Mouse Gene 2.0/2.1芯片和Human Gene 2.0/2.1具有相同的设计理念,该芯片可以同时检测小鼠的mRNAlincRNA(long intergenic-coding RNA),并通过Affymetrix®  Transcriptome Analysis Console(TAC)软件进行基因水平、外显子水平及可变剪切分析。

 

3’IVT表达谱芯片(3’Expression Arrays):主要针对基因3’末端上游约600bp的序列设计约11PM-MM探针,这些探针检测到的信号值与靶标序列的表达水平存在线性关系。这类芯片包括人U133 plus2.0;小鼠430 2.0;大鼠230 2.0等多个物种的经典产品。

GeneChip®  Human Genome U133 plus 2.0芯片:为第一张人类全基因组基因表达综合分析芯片,是3’IVT基因表达芯片的金标准。

 

miRNA 4.0 芯片

全方位了解编码及非编码转录本调控

许多疾病,包括癌症,往往可以被看作是基因表达错乱所引起的。据估计,30%以上的编码基因翻译成蛋白质都是由miRNA调控。越来越多的证据也表明,miRNA与信号网络中调控可变剪接事件的长链非编码RNA(long non-coding RNA)相互作用,从而影响了凋亡、增值和分化等细胞过程-所有这一切都可能成为各种疾病(比如癌症)的致病因素。检测这些关键调控节点的变化对于研究差异表达基因的生物学北京极为重要。miRNA4.0芯片是一个强大的工具,有助于研究非编码RNA的作用及其在发育和生理机制中的参与程度。